در تقدیرنامه صادره از سوی حجت اله عبدالملکی، مشاور رئیس‌جمهور و دبیر شورا؛ با بیان اینکه در راستای اجرای بند (د) تبصره ۷ بودجه ۱۴۰۳ کشور؛ دبیرخانه شورای‌عالی مناطق آزاد و ویژه اقتصادی اقدام به رصد، کنترل، پایش و نظارت بر حسن اجرای وظایف و مأموریت‌های محوله، پیرو ابلاغ شاخص‌های تخصصی با استناد به قوانین و اسناد بالادستی، بخشنامه‌ها و مصوبات شورای‌عالی نموده؛ تصریح شده که سازمان منطقه آزاد انزلی در مجموع کل شاخص‌های ارزیابی حوزه‌های مختلف بین سازمان‌های مناطق آزاد (ارس، ماکو، کیش، قشم، چابهار و اروند) حائز رتبه برتر شده است.
بنابراین گزارش مولفه‌های ارزیابی عملکرد مناطق آزاد شامل: شاخص‌های ارزیابی ارتقای اثربخش نظام اداری و بهبود مدیریت منابع؛ حوزه تصویرسازی (روابط‌عمومی و امور بین‌الملل)؛ حوزه فرهنگی و اجتماعی؛ حوزه فناوری اطلاعات؛ حوزه عمرانی و زیربنایی؛ و در نهایت حوزه اقتصادی بوده که در مجموع این شاخص‌های بررسی شده توسط دبیرخانه شورای‌عالی؛ منطقه آزاد انزلی مقام اول و برتر را به دست آورده است.